Svojo celotno košarkarsko kariero, do prihoda v Cedevito Olimpijo pred začetkom sezone 2022/23, je Lovro Gnjidić preživel v zagrebški Ciboni. Odrastel je v okviru ekip mlajših starostnih kategorij kluba iz hrvaške prestolnice, leta 2020 pa je tam tudi začel svojo profesionalno kariero.

Sezono 2023/24 je Lovro preživel v Splitu in Megi, pred začetkom tekmovalne sezone 2024/25 pa se je vrnil v Zmajevo družino. Njegovo sezono so zaznamovale zdravstvene težave, zaradi katerih je izpustil uvod v redni del sezone, v marcu 2025 pa je bil posojen v špansko Palencio.

V Evropskem pokalu je v sezoni 2024/25 v dresu Cedevite Olimpije odigral tri tekme in v povprečju dosegal 1,3 točke ter 0,7 asistence na tekmo, v regionalni ligi pa je zaigral na devetih tekmah in v 5,6 minutah, ki jih je preživel na parketu, dosegal 1,3 točke in 0,6 skokov na tekmo. Za Palencio je v sezoni 2024/25 zaigral na sedmih tekmah druge španske lige, dosegal pa 3,0 točke in 2,6 skoka na tekmo.